Čakry mají také spojitost s energetickými kanály, meridiány i s ostatními prolínajícími se jemněhmotnými těly, jež prostupují tělo fyzické a tvoří i jeho energetický obal - auru. Frekvence vibrací a rozvinutí těchto těl je dána duchovní úrovní každého jednotlivce.

 Blokace :

    Někdy mohou být některé, většina, vyjímečně všechny, čakry blokovány, což způsobuje, že životní energie nemůže volně proudit (u blokovaných čaker je jejich frekvence vibrací nízká a někdy až neznatelná). Tyto blokace mohou být nejčastěji způsobeny strachem, zklamáním, napětím, šokem, negativními vlivy na člověka z okolí a podobně. 

    Tyto blokády lze uvolnit a čakry harmonizovat například tím, že čakry vystavíme vibracím energie takových frekvencí, na kterých harmonicky fungující čakra bez jakýchkoli blokád kmitá naprosto přirozeně. (takovéto frekvence vibrací se nacházejí například u drahokamů, eterických olejů, čistých zářivých barev, tónů apod.) Čakry lze harmonizovat i pomocí dechových cvičení. Je velice jednoduché - stačí jen trochu představivosti, soustředte se na oblast konečnílu a pak postupujte po páteři směrem vzhůru k hlavě a představte si že nergie začíná proudit od spodu směrem k hlavě a prochází hlavou vzhůru a pak opačným směrem k zemi (Nahoru s nádechem dolů s výdechem). Tím si pročistíte páteřní kanál a posílíte energii v jednotlivých čakrách. Pokud na některém místě těla ucítíte slabou bolest  - v tomto místě je koloběh energii blokován. Soustřeďte se i na toto místo a nechte enenrgii proudit. Blok se po čase uvolní. (Dalš informace o čištění čaker naleznete zde.) Pokud se blok projeví v místě některého orgánu, návod, kde hledat příčinu - informace o duchovních příčinách nemoci, naleznete zde.

    Existuje mnoho způsobů, jak zjistit možnou blokaci jednotlivých čaker. Nejjednodušší, spolehlivé a "snadno" proveditelné jsou asi tyto způsoby: kyvadlo, vycítění rukama a pozorování aury. Pozorování aury však většinou není možné bez předchozího nácviku a tréninku a zatím ne každý dokáže auru vidět (i když tato dovednost je dána do vínku každému). Podobné je to i s "osaháváním" čaker rukama, kdy můžeme cítit sílu proudící energie. Nejvhodnější a nejjednodušší je tedy použití kyvadla. Harmonická čakra způsobuje velké kruhy, opisovány ve směru otáčivého pohybu čakry, nad narušenou čakrou kyvadélko opisuje kruhy malé nebo dokonce žádné. Pro zdravý organism je třeba správná funkce čaker a optimálně silná aura.